相較于本科畢業論文而言，碩士畢業論文是100%需要通過知網查重的，一般而言，各校關于碩士畢業論文的查重率規定雖有所不同，但基本上都規定查重率不得超過10%-20%，這也意味著碩士畢業論文的知網查重率必須要更為嚴格的控制。 知網VIP5.3系統雖然較之于以前的知網查重系統進行了升級，但是其重復率計算規則仍然是按照連續十三字符以上重復計算為重復部分，這也意味著學生可以巧妙的利用該規則避免重復。
碩士畢業論文查重一般要求的高一點，有的學校甚至要求3%內，并且還有單章復制比要求！ ！ ！ 1、大部分高校要求碩士論文的字數通常是在3萬字以上，要求比較嚴格的會在7萬字以上，并會規范論文的格式要求，原因之一就是為了論文檢測時的結果能夠準確無誤。
封面、摘要、緒論、第一章、第二章、等等這樣一系列的都會各自分成一個片段來檢測，每一個片段都計算出一個相似度，再通過這樣每章的相似度來計算出整篇論文的總重復率。 當知網查重系統識別到你論文中有某句話涉嫌抄襲的時候，它就會對這句話的前面后面部分都重點進行模糊識別，這個時候判斷標準就變得更嚴格，僅僅加一些副詞或虛詞 (比如“的”、“然后”、“但是”、“所以”此類詞語）是能夠識別出來的。 在知網查重進行中，檢測系統只能識別文字部分，論文中的圖片、word域代碼、mathtype編輯的公式、是不檢測的，因為檢測系統尚無法識別這些復雜的內容格式。
