寫全稱時一般是全部用小寫，除非是人名、地名等專有名詞，而縮寫一般是全大寫，除非是約定俗成的寫法，比如用 ChIP 代表 chromatin immunoprecipitation。 雖然有時候我們可能覺得某個縮寫是論文所在領域非常普遍使用的，沒有必要定義，可是還是應該考慮到也許有其他領域或者新進入這門領域的讀者會閱讀這篇論文，所以期刊都規定縮略語要先定義再使用。 確實有不需要定義就可以使用的縮略語，比如 DNA，RNA，mRNA 在生物醫學領域的文章中就不需要定義，標準單位寫在數字之后 (2 kg，5 mL)也不需要定義。 但是這種所謂的標準縮略語并不多，如果不能確定還是在第一次出現時給出全稱比較好，例如用 miR 代替 microRNA 還是需要定義的。
