全文有一個重復部分，一個部分是刪除被引用文獻的重復率，因此，一般來說，即使作者引用其他論文，也只需證明引文的模式是正確的。 一般情況下，它將被學術論文查重系統自動識別為引用部分，以綠色字體標記，并顯示刪除引用文獻的重復率。
引用的文獻需要精挑細選的，要引用與自己的研究領域有密切關系的。 同時還要注重引用文獻的質量，在該學術領域能起到重要影響的文獻，這是引用的首選；低劣的文獻普遍存在，有些期刊的刊登的文章，就不要作為參考文獻，若引用文獻，說不準還會降低自己的學術水準。
如果論文中因為引用導致重復率超標，那只能說是“過度引用”。 這種情況下，需要將一部分引用的內容，轉換為“間接引用”。 或者用自己的語言重新進行描述。 注意：“過度引用”也算是學術不端行為的一種。
根據已有研究成果及經驗，一般的基礎研究、理論研究論文引用的參考文獻數量在10篇左右，綜述性論文引用的文獻數量可以多一些，技術性、實驗性論文引用文獻相對較少。 參考文獻的選擇，應該根據文章的需要來確定，以數量最少、質量最優、作用最佳、成果最新為基本原則。
